南京事件の証人として、東京裁判で、日本軍による殺人、強姦、略奪事件について、被害者からの直接聴取、自ら行った被害調査などを基に証言を行った人物にジョン・マギー牧師（John Gillespie Magee）がいる。マギー牧師は次のように日記に書いている。
Sunday --- Dec.19
The horror of the last week is beyond anything I have ever experienced. I never dreamed that the Japanese soldiers were such savages. It has been a week of murder and rape, worse, I imagine, than has happened for a very long time unless the massacre of the Armenians by the Turks was comparable. They not only killed every prisoner they could find but also a vast number of ordinary citizens of all ages. Many of them were shot down like the hunting of rabbits in the streets. There are dead bodies all over the city from the south city to Hsiakwan.
Just day before yesterday we saw a poor wretch killed very near the house where we are living. So many of the Chinese are timid and when challenged foolishly start to run. This is what happened to that man. The actual killing we did not see as it took place just around the corner of a bamboo fence from where we could see. Cola went there later and said the man had been shot twice in the head. These two Jap. soldiers were no more concerned than if they had been killing a rat and never stopped smoking cigarettes and talking and laughing.
―Zhang Kaiyuan, Eyewitnesses to Massacre: American Missionaries Bear Witness to Japanese Atrocities in Nanjing、p. 171
12月19日（日）
先週の恐怖は、私が経験したことがないものだ。私は、日本兵がこれほど残忍だとは夢にも思わなかった。想像するに、トルコ人によるアルメニア人の虐殺が比較され得るのを除けば、とても長い間これまで起ったものよりもひどい殺人とレイプの１週間だった。彼らは見付けられ得るすべての捕虜だけでなく膨大な数のあらゆる年齢の一般市民をも殺した。彼らの多くは通りでウサギ狩りのように射殺された。市の南部から下関まで、町が死体で覆われた。
一昨日、私たちが住んでいる家のとても近くで一人の気の毒な人が殺されたのを見た。シナ人のとても多くが臆病で誰何（すいか）されると愚かにも走り出すのだ。これがその人に起ったことだ。竹の囲いの角をすぐ廻った所で起ったので、我々が見ることの出来る所からは実際の殺害は見ていない(下線、池内)。コーラが後でそこに行って、その男は頭を二発撃たれていたと言った。この２人の日本兵は、ネズミを殺しているかのごとく意に介せず、ずっと煙草を吸い、喋り、笑っていた。
そのマギー牧師は、東京裁判において、ブルックス弁護人の反対尋問に次のように応えている。
〇ブルックス辨護人 「マギー證（証）人、ソレデハ只今ノ御話二ナツタ不法行爲者若（モ）シクハ殺人行爲ト云フモノノ現行犯ヲ、アナタ御自身畿ラ位御覧ニナリマシタカ
〇マギー證人 私ハ自分ノ證言ノ中デハツキリト申シテアルト思ヒマスガ、唯僅力一人ノ事件ダケハ自分デ目撃致シマシタ
実際に見たのは1人だけとは拍子抜けもいいところである。否、先ほどの日記にはその1人さえも実際には目撃していないとある。
一方、「南京大虐殺肯定派」は、マギー証言は信憑性が高いと言う。渡辺春巳・弁護士は言う。
《日本兵が中国人を殺す瞬間を目撃したのは、１件であるが、マギーは中国人が路上を連行されていくところを目撃し、そのように運行されて行った市民が集団殺害されたのを、奇跡的に逃げ帰った知り合いの中国人から具体的に殺害の状況を聞き取り、かつ自分でそのような集団殺害の跡に数多くの死体が放置されていたのを目撃しているのである》（『南京大虐殺否定論 13のウソ』（柏書房）、p. 192）
自分の日記に実際は目撃してないと書いているのに、どうしてマギー証言の信憑性が高いと言えるのだろうか。後段部分もただ「見ました」と言っているに過ぎない。
《たしかに殺害場面だけは伝聞であるが、証言内容が具体的であり、直接目撃している事実とも符合し、前後の事実の流れも自然であって、その信憑性は高い》（同）
すべて主観の域を出ない。＜集団殺害の跡に数多くの死体が放置されていた＞にもかかわらず、南京攻略戦に同行していた日本のマスコミも文化人も何の声も挙げていない。
《南京攻略戦に同行取材した日本のメディアは、朝日、毎日以外にも報知新聞（現、読売新聞）、読売新聞、同盟通信（現、共同、時事）、新愛知新聞（現、中日）、福岡日々新聞（現、西日本）、都新聞（現、東京）、福島民報など全国の主要メディアも参加していた。その他、大宅壮一、西條八十、草野心平、林芙美子、石川達三、小磯良平など、作家、詩人、評論家、画家も多数、南京に入城しているが、戦後、新聞労連の活動を熱心にしていた朝日と毎日の数名以外、南京で「虐殺」があったと語ったものはいない》（『南京の実相』（日新報道）、p. 42）【了】
